农产品检测实验室的目的就是检测农产品的质量，为生产者、消费者及政府提供科学、准确的质量数据，为整个社会服务。实验室是人员和仪器设备共同工作的场所，会用到大量的有毒有害试剂，会对实验室人员、仪器甚至周围环境造成不利的影响。实验室在建设和运行过程中会消耗大量的资源和能源，因此，还要考虑实验室的运行成本。因此，建设农产品检测实验室应遵循“三个保护，两个节约和一个确保”的原则。三个保护，就是要做到对人员的保护、对仪器设备的保护和对周围环境的保护。两个节约，就是在建设过程中节约资源，在使用过程中节约能源。一个确保，就是所有目的只有一个，确保检测结果准确可靠。

      农产品检测实验室一般为社会第三方公益机构，承担着各方委托检验任务，通过国家相关部门的计量认证和审查认可，在结构布局上应首先满足评审要求。

      农产品检测实验室因使用大量有机、无机化学试剂甚至剧毒化学物品而对环境有很大的污染性，因此实验室建设应远离居民区。考虑到实验室通风要求和节约能源，实验室应为独立建筑，多层建筑比较好，如果是共用建筑，应该在多层建筑特别是高层建筑的顶部比较好，这样在实验室的通风设计和使用时会节约大量的资源和能源，并且通风效果较好。

      因工作需要，农产品检测实验室可设置如下几个部分：业务收样室、样品贮藏室、样品处理室、试剂贮藏室、样品检测前处理室、仪器分析室、称量室、烘干室、标准溶液配置室、感官分析室、品质分析室、微生物检测室、转基因成分检测室、食品毒理分析室等。每个部分都有基本要求和特殊要求，业务收样室主要与客户打交道，接收样品和发送检测报告，处理客户抱怨，是实验室工作的窗口，应设置在建筑物的一层靠近门厅的位置或者每层建筑中厅的位置，总之，一切以方便客户为准则。样品检测前处理室主要考虑通风要求。仪器分析室主要考虑用电负荷、控温控湿、气路、地线、消防手段等要求。称量室要考虑气流稳定、无振动、隔离缓冲等要求。标液配制室要考虑独立空间、防止交叉污染等要求。微生物检测室、转基因成分检测室、食品毒理分析室等洁净区域应满足国家相关技术规范要求。